Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms