Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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TRAF3Q13114 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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