Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms