Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPI1P17947 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms