Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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