Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMB4Q86W47 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms