Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 AIMP1-204ENST00000510207 568 ntTSL 45.83□□□□□ -1.482e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PSPC1-202ENST00000427943 866 ntTSL 519.33■□□□□ 0.684e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.026e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 HNRNPK-207ENST00000472778 822 ntTSL 36.21□□□□□ -1.427e-29■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 HNRNPK-203ENST00000376256 562 ntTSL 25.41□□□□□ -1.547e-29■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 520.07■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 223.41■■□□□ 1.348e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.455e-27■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.365e-27■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.155e-27■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.125e-27■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.075e-27■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.175e-27■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PTGES3-206ENST00000537473 2939 ntTSL 213.13□□□□□ -0.315e-27■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.65e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.485e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.625e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCT5-202ENST00000423695 1232 ntTSL 210.11□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.065e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.245e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCT5-211ENST00000512975 578 ntTSL 46.24□□□□□ -1.415e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 MACF1-216ENST00000476350 5304 ntTSL 28.2□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 MACF1-229ENST00000530262 6257 ntTSL 57.09□□□□□ -1.273e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.443e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 55.69□□□□□ -1.53e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.683e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.753e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.793e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 26.92□□□□□ -1.32e-19■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ARHGAP4-223ENST00000494397 1752 ntTSL 521.18■□□□□ 0.984e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ARHGAP4-217ENST00000466928 840 ntTSL 219.71■□□□□ 0.754e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CSDE1-212ENST00000529046 571 ntTSL 46.4□□□□□ -1.384e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CSDE1-209ENST00000525132 521 ntTSL 54.88□□□□□ -1.634e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARS-204ENST00000586807 1608 ntTSL 210.94□□□□□ -0.663e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.615e-11■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.215e-11■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CYCS-204ENST00000413447 498 ntTSL 313.71□□□□□ -0.215e-11■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.185e-11■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 515.34■□□□□ 0.058e-24■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 214.7□□□□□ -0.068e-24■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-214ENST00000530132 542 ntTSL 422.39■■□□□ 1.173e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-217ENST00000533195 560 ntTSL 422.39■■□□□ 1.173e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-218ENST00000533532 584 ntTSL 222.39■■□□□ 1.173e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-216ENST00000532456 664 ntTSL 420.88■□□□□ 0.933e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX41-217ENST00000515562 1184 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.564e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX41-219ENST00000629036 606 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.544e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX41-211ENST00000510171 569 ntTSL 311.53□□□□□ -0.564e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 519.89■□□□□ 0.773e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 217.47■□□□□ 0.393e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 516.11■□□□□ 0.173e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.778e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.718e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.348e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 516.35■□□□□ 0.218e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.188e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 514.57□□□□□ -0.088e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.548e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 511.2□□□□□ -0.628e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.055e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.565e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PGGHG-205ENST00000474221 4418 ntTSL 213.62□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.782e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 512.16□□□□□ -0.462e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.492e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.832e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 38.02□□□□□ -1.132e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.182e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.222e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 216.51■□□□□ 0.234e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 LTBP4-220ENST00000598166 699 ntTSL 516.36■□□□□ 0.214e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 56.24□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ISYNA1-209ENST00000582287 696 ntTSL 1 (best)21.25■□□□□ 0.993e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.883e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.83e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.753e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.473e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-205ENST00000392483 581 ntTSL 217.43■□□□□ 0.383e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.233e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.213e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-212ENST00000532978 2489 ntTSL 216.35■□□□□ 0.213e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.063e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-210ENST00000532423 507 ntTSL 214.24□□□□□ -0.133e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.173e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-209ENST00000530868 650 ntTSL 313.87□□□□□ -0.193e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-206ENST00000496493 729 ntTSL 312.63□□□□□ -0.393e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.393e-9■□□□□ 9.2
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 314.9 ms