Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A3Q14050 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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