Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 C8orf44-204ENST00000521113 575 ntTSL 29.2□□□□□ -0.945e-9■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.185e-9■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 C8orf44-SGK3-202ENST00000520044 628 ntTSL 35.23□□□□□ -1.575e-9■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)20.73■□□□□ 0.911e-6■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-6■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-6■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.881e-6■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.842e-14■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 U2AF2-208ENST00000592874 849 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-14■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.784e-11■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.574e-11■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.516e-6■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 SSH1-208ENST00000548522 602 ntTSL 317.02■□□□□ 0.326e-6■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 UPF1-213ENST00000601981 556 ntTSL 59.7□□□□□ -0.864e-11■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.426e-6■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.446e-6■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 UCK2-203ENST00000463772 599 ntTSL 55.98□□□□□ -1.453e-11■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 ARF1-208ENST00000478336 930 ntTSL 223.57■■□□□ 1.361e-7■■■□□ 19.2
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TARDBPQ13148 RPL22-206ENST00000480661 2279 ntTSL 1 (best)18.95■□□□□ 0.621e-6■■■□□ 19.1
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TARDBPQ13148 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.975e-7■■■□□ 19
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TARDBPQ13148 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.685e-7■■■□□ 19
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TARDBPQ13148 SND1-204ENST00000465900 630 ntTSL 45.77□□□□□ -1.498e-7■■■□□ 19
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TARDBPQ13148 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.781e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 35.76□□□□□ -1.491e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 LIMS1-208ENST00000428064 637 ntTSL 221.34■■□□□ 1.011e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-7■■■□□ 19
TARDBPQ13148 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 19
TARDBPQ13148 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 19
TARDBPQ13148 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-8■■■□□ 19
TARDBPQ13148 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.45e-8■■■□□ 19
TARDBPQ13148 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 56.86□□□□□ -1.315e-8■■■□□ 19
TARDBPQ13148 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.281e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 GGNBP2-216ENST00000618837 2346 ntTSL 217.13■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 GGNBP2-215ENST00000617860 3497 ntTSL 213.68□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-213ENST00000508569 1882 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.622e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-215ENST00000509349 582 ntTSL 59.48□□□□□ -0.892e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-219ENST00000511086 689 ntTSL 29.48□□□□□ -0.892e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-229ENST00000627659 2393 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 19
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