Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms