Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y5

PEX16, Peroxisomal membrane protein PEX16, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX16Q9Y5Y5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX16Q9Y5Y5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PEX16Q9Y5Y5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX16Q9Y5Y5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX16Q9Y5Y5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX16Q9Y5Y5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX16Q9Y5Y5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms