Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUBP2Q9Y5Y2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUBP2Q9Y5Y2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUBP2Q9Y5Y2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUBP2Q9Y5Y2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms