Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf18Q9UK00 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf18Q9UK00 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf18Q9UK00 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms