Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC23Q9UJX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC23Q9UJX2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDC23Q9UJX2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms