Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEFF2Q9UIK5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEFF2Q9UIK5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEFF2Q9UIK5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEFF2Q9UIK5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms