Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC23A1Q9UHI7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC23A1Q9UHI7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A1Q9UHI7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms