Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ2Q9P299 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ2Q9P299 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ2Q9P299 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ2Q9P299 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ2Q9P299 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ2Q9P299 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ2Q9P299 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPZ2Q9P299 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPZ2Q9P299 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPZ2Q9P299 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPZ2Q9P299 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ2Q9P299 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms