Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SENP1Q9P0U3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP1Q9P0U3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP1Q9P0U3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP1Q9P0U3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms