Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLRF1Q9NZS2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLRF1Q9NZS2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLRF1Q9NZS2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLRF1Q9NZS2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLRF1Q9NZS2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLRF1Q9NZS2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLRF1Q9NZS2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLRF1Q9NZS2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLRF1Q9NZS2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLRF1Q9NZS2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRF1Q9NZS2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms