Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT2Q9NZN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT2Q9NZN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms