Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN3BQ9NY72 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN3BQ9NY72 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN3BQ9NY72 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms