Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHCHD3Q9NX63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD3Q9NX63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms