Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMBRD1Q9NUN5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBRD1Q9NUN5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBRD1Q9NUN5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBRD1Q9NUN5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms