Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG4Q9H9E3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG4Q9H9E3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
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