Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN4Q9H254 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN4Q9H254 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTBN4Q9H254 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBN4Q9H254 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms