Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM8Q9BZR9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM8Q9BZR9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms