Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL3Q9BY60 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms