Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBB2BQ9BVA1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB2BQ9BVA1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB2BQ9BVA1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TUBB2BQ9BVA1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBB2BQ9BVA1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms