Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VKORC1Q9BQB6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VKORC1Q9BQB6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VKORC1Q9BQB6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms