Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIB1Q99828 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIB1Q99828 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIB1Q99828 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIB1Q99828 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms