Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF12Q96QT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHF12Q96QT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF12Q96QT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms