Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC9Q96Q05 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms