Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABS1Q96KC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABS1Q96KC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABS1Q96KC9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms