Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DCHS1Q96JQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DCHS1Q96JQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCHS1Q96JQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms