Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX11Q96FC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX11Q96FC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX11Q96FC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX11Q96FC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms