Protein–RNA interactions for Protein: Q96E52

OMA1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OMA1Q96E52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OMA1Q96E52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OMA1Q96E52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OMA1Q96E52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OMA1Q96E52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms