Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM19Q96E16 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM19Q96E16 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms