Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L1Q96BA8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L1Q96BA8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREB3L1Q96BA8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREB3L1Q96BA8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms