Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORBQ92753 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORBQ92753 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORBQ92753 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORBQ92753 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORBQ92753 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORBQ92753 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORBQ92753 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORBQ92753 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORBQ92753 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORBQ92753 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORBQ92753 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORBQ92753 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORBQ92753 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORBQ92753 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORBQ92753 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORBQ92753 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORBQ92753 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORBQ92753 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORBQ92753 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORBQ92753 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORBQ92753 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORBQ92753 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORBQ92753 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORBQ92753 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORBQ92753 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORBQ92753 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORBQ92753 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORBQ92753 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORBQ92753 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORBQ92753 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORBQ92753 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RORBQ92753 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORBQ92753 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORBQ92753 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORBQ92753 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORBQ92753 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORBQ92753 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORBQ92753 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RORBQ92753 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORBQ92753 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORBQ92753 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORBQ92753 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORBQ92753 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORBQ92753 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORBQ92753 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORBQ92753 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORBQ92753 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORBQ92753 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORBQ92753 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORBQ92753 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORBQ92753 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORBQ92753 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORBQ92753 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORBQ92753 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORBQ92753 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORBQ92753 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORBQ92753 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORBQ92753 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORBQ92753 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORBQ92753 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORBQ92753 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORBQ92753 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORBQ92753 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORBQ92753 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORBQ92753 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORBQ92753 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORBQ92753 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORBQ92753 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORBQ92753 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORBQ92753 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORBQ92753 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORBQ92753 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORBQ92753 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORBQ92753 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORBQ92753 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORBQ92753 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORBQ92753 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORBQ92753 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORBQ92753 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORBQ92753 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORBQ92753 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RORBQ92753 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RORBQ92753 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORBQ92753 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORBQ92753 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORBQ92753 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORBQ92753 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms