Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE23Q8NDY6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHLHE23Q8NDY6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE23Q8NDY6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms