Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC63Q8NA47 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC63Q8NA47 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC63Q8NA47 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms