Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMER3Q8N944 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMER3Q8N944 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AMER3Q8N944 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms