Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ02

LRRC34, Leucine-rich repeat-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC34Q8IZ02 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC34Q8IZ02 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC34Q8IZ02 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC34Q8IZ02 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC34Q8IZ02 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC34Q8IZ02 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC34Q8IZ02 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC34Q8IZ02 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms