Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRAIDQ6UW56 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRAIDQ6UW56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRAIDQ6UW56 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms