Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA2Q6UW10 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA2Q6UW10 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms