Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG16L1Q676U5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG16L1Q676U5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG16L1Q676U5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG16L1Q676U5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms