Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD3Q5JSP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD3Q5JSP0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms