Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCU0

Putative uncharacterized protein FLJ37770, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3ZCU0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3ZCU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3ZCU0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Q3ZCU0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3ZCU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms