Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ40

CCDC144B, Coiled-coil domain-containing protein 144B, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144BQ3MJ40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC144BQ3MJ40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC144BQ3MJ40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC144BQ3MJ40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144BQ3MJ40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144BQ3MJ40 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144BQ3MJ40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144BQ3MJ40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC144BQ3MJ40 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms