Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZFHX3Q15911 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZFHX3Q15911 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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